Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HNF4GQ14541 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HNF4GQ14541 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms