Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BECN1Q14457 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
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