Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SCARB2Q14108 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SCARB2Q14108 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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