Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CIRBPQ14011 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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