Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKD2Q13563 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKD2Q13563 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
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