Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ERCC8Q13216 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ERCC8Q13216 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ERCC8Q13216 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ERCC8Q13216 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ERCC8Q13216 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ERCC8Q13216 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ERCC8Q13216 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ERCC8Q13216 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ERCC8Q13216 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ERCC8Q13216 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ERCC8Q13216 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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