Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CALCOCO2Q13137 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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