Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RESTQ13127 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RESTQ13127 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RESTQ13127 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RESTQ13127 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RESTQ13127 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RESTQ13127 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RESTQ13127 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RESTQ13127 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RESTQ13127 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RESTQ13127 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RESTQ13127 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RESTQ13127 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RESTQ13127 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RESTQ13127 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RESTQ13127 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RESTQ13127 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RESTQ13127 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RESTQ13127 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RESTQ13127 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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RESTQ13127 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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RESTQ13127 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RESTQ13127 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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RESTQ13127 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RESTQ13127 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RESTQ13127 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RESTQ13127 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RESTQ13127 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RESTQ13127 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RESTQ13127 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RESTQ13127 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RESTQ13127 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
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