Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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KCNMA1Q12791 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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KCNMA1Q12791 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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KCNMA1Q12791 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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KCNMA1Q12791 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNMA1Q12791 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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