Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CD47Q08722 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CD47Q08722 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CD47Q08722 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms