Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GOLGA3Q08378 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GOLGA3Q08378 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms