Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHRNB3Q05901 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB3Q05901 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms