Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CENPCQ03188 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPCQ03188 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms