Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
BNC1Q01954 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
BNC1Q01954 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms