Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F1Q01094 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E2F1Q01094 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms