Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
BEX3Q00994 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BEX3Q00994 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms