Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MDM2Q00987 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MDM2Q00987 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms