Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms