Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNB1P98172 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms