Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUCB2P80303 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms