Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA4AP68366 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA4AP68366 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms