Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP9P55211 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP9P55211 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP9P55211 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CASP9P55211 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CASP9P55211 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms