Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EMP1P54849 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EMP1P54849 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EMP1P54849 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EMP1P54849 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EMP1P54849 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EMP1P54849 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
EMP1P54849 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EMP1P54849 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EMP1P54849 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EMP1P54849 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EMP1P54849 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EMP1P54849 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
EMP1P54849 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
EMP1P54849 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EMP1P54849 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EMP1P54849 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EMP1P54849 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EMP1P54849 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EMP1P54849 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EMP1P54849 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EMP1P54849 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EMP1P54849 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EMP1P54849 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EMP1P54849 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EMP1P54849 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EMP1P54849 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EMP1P54849 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EMP1P54849 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EMP1P54849 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EMP1P54849 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms