Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AP2S1P53680 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms