Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LUMP51884 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LUMP51884 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LUMP51884 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LUMP51884 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LUMP51884 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LUMP51884 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LUMP51884 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LUMP51884 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LUMP51884 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LUMP51884 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LUMP51884 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LUMP51884 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LUMP51884 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LUMP51884 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LUMP51884 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LUMP51884 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LUMP51884 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LUMP51884 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LUMP51884 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LUMP51884 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LUMP51884 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LUMP51884 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LUMP51884 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms