Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PPT1P50897 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PPT1P50897 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PPT1P50897 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPT1P50897 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPT1P50897 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPT1P50897 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPT1P50897 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPT1P50897 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PPT1P50897 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PPT1P50897 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PPT1P50897 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms