Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSK3BP49841 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GSK3BP49841 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms