Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXA1P49639 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms