Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SOX2P48431 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SOX2P48431 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SOX2P48431 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms