Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ME1P48163 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME1P48163 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME1P48163 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME1P48163 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME1P48163 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME1P48163 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME1P48163 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME1P48163 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME1P48163 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME1P48163 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME1P48163 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME1P48163 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME1P48163 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME1P48163 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ME1P48163 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ME1P48163 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME1P48163 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME1P48163 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME1P48163 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME1P48163 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME1P48163 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME1P48163 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME1P48163 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME1P48163 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME1P48163 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME1P48163 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME1P48163 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ME1P48163 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ME1P48163 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ME1P48163 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ME1P48163 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ME1P48163 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ME1P48163 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ME1P48163 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ME1P48163 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ME1P48163 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ME1P48163 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms