Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL29P47914 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL29P47914 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL29P47914 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL29P47914 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms