Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RANGAP1P46060 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RANGAP1P46060 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms