Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACADSBP45954 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACADSBP45954 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms