Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ETFBP38117 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ETFBP38117 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETFBP38117 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETFBP38117 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETFBP38117 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETFBP38117 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETFBP38117 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETFBP38117 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETFBP38117 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ETFBP38117 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ETFBP38117 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETFBP38117 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ETFBP38117 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFBP38117 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFBP38117 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFBP38117 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFBP38117 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFBP38117 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFBP38117 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFBP38117 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFBP38117 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFBP38117 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFBP38117 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFBP38117 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFBP38117 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFBP38117 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFBP38117 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ETFBP38117 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ETFBP38117 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETFBP38117 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETFBP38117 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETFBP38117 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETFBP38117 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETFBP38117 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ETFBP38117 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms