Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHI3L1P36222 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHI3L1P36222 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms