Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT9P35527 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT9P35527 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT9P35527 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT9P35527 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT9P35527 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT9P35527 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT9P35527 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT9P35527 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT9P35527 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT9P35527 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT9P35527 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT9P35527 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT9P35527 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT9P35527 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT9P35527 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KRT9P35527 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms