Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPA4P34932 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPA4P34932 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms