Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL4A5P29400 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL4A5P29400 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms