Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ABCD3P28288 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ABCD3P28288 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms