Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA5P28066 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms