Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PSMA3P25788 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms