Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPREP23469 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPREP23469 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPREP23469 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPREP23469 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPREP23469 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPREP23469 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPREP23469 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPREP23469 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPREP23469 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPREP23469 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPREP23469 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPREP23469 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPREP23469 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPREP23469 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPREP23469 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPREP23469 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPREP23469 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPREP23469 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPREP23469 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPREP23469 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPREP23469 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPREP23469 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPREP23469 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPREP23469 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPREP23469 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPREP23469 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPREP23469 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPREP23469 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PTPREP23469 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms