Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CD33P20138 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD33P20138 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD33P20138 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD33P20138 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms