Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHCEP18577 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHCEP18577 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHCEP18577 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHCEP18577 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHCEP18577 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHCEP18577 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHCEP18577 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHCEP18577 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHCEP18577 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHCEP18577 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHCEP18577 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHCEP18577 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHCEP18577 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHCEP18577 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHCEP18577 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms