Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSP16219 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSP16219 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ACADSP16219 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACADSP16219 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACADSP16219 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACADSP16219 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ACADSP16219 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACADSP16219 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSP16219 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSP16219 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms