Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPBP14678 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms