Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ODC1P11926 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ODC1P11926 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ODC1P11926 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ODC1P11926 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ODC1P11926 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ODC1P11926 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODC1P11926 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODC1P11926 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODC1P11926 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODC1P11926 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODC1P11926 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODC1P11926 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODC1P11926 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODC1P11926 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODC1P11926 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODC1P11926 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODC1P11926 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ODC1P11926 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms