Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAPPC2P0DI81 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms