Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLK3P07288 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLK3P07288 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLK3P07288 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLK3P07288 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLK3P07288 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLK3P07288 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLK3P07288 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLK3P07288 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLK3P07288 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLK3P07288 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLK3P07288 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLK3P07288 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLK3P07288 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLK3P07288 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLK3P07288 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLK3P07288 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLK3P07288 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLK3P07288 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms