Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX6O95475 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX6O95475 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX6O95475 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX6O95475 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX6O95475 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX6O95475 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIX6O95475 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIX6O95475 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIX6O95475 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIX6O95475 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIX6O95475 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIX6O95475 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SIX6O95475 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SIX6O95475 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX6O95475 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX6O95475 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX6O95475 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX6O95475 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX6O95475 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX6O95475 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX6O95475 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX6O95475 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX6O95475 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX6O95475 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX6O95475 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX6O95475 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX6O95475 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SIX6O95475 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms